ไทม์ไครซิส 3 ได้รวมระบบอาวุธชนิดใหม่ที่อนุญาตให้ผู้เล่นสลับระหว่างปืนพกมาตรฐาน 9 นัด, ปืนกลอัตโนมัติเต็มรูปแบบที่สามารถจุ 200 นัด, ปืนลูกซองกับกระสุน 50 นัด และเครื่องยิงลูกระเบิด 5 นัดพร้อมความเสียหายซัดสาดที่ทรงพลัง ปืนพกเท่านั้นที่มีกระสุนไม่จำกัด แม้ว่าผู้เล่นจะสามารถยิงทหารที่สวมชุดสีเหลืองเพื่อรับกระสุนสำหรับอาวุธอื่น ๆ คุณสมบัตินี้ถูกใช้ในพอร์ตไครซิสโซนในภายหลัง โดยมีการเปลี่ยนแปลงบางอย่าง

เกมดังกล่าวยังปรับปรุงระบบแสงแลบวิกฤตซึ่งการยิงที่เป็นอันตรายต่อชีวิตในเกมจะสว่างขึ้น ทำให้คำแนะนำในการปล่อยคันเหยียบนั้นง่ายขึ้น

ชื่อนี้ได้รับการเปิดตัวในภายหลังสำหรับเพลย์สเตชัน 2 พร้อมกับเนื้อเรื่องฝั่งอลิเซีย วินสตัน ในฐานะผู้เล่น ซึ่งเป็นเพียงผู้สนับสนุนที่เล่นไม่ได้ในเกมเวอร์ชันอาร์เคด รูปแบบการเล่นสำหรับอลิเซียส่วนใหญ่เหมือนกับแคมเปญปกติ พร้อมด้วยส่วนที่ผู้เล่นจะต้องใช้ปืนไรเฟิลซุ่มยิงเป็นครั้งคราวเพื่อจัดการกับพลซุ่มยิงของศัตรู ผิดกันกับไทม์ไครซิส และไทม์ไครซิส II พอร์ตคอนโซลบ้านประกอบด้วยองค์ประกอบของโครงเรื่อง, คุณสมบัติ และอาวุธที่ไม่พบในอาร์เคด เช่นเดียวกับเวอร์ชันไทม์ไครซิส II ของเพลย์สเตชัน 2 ผู้เล่นสามารถเข้าถึงเมนูการฝึกฝนไครซิสมิชชันผ่านการเล่นเกมที่ยาวนานขึ้น